Viry, baktérie, pyly a další choroboplodné zárodky se nacházejí na površích a ve vzduchu. Zejména v uzavřených prostorech může být jejich koncentrace velmi vysoká. Filtrační systémy přispívají k rozhodujícímu snížení koncentrace těchto zdraví škodlivých látek v okolním vzduchu. Navíc jsou ze vzduchu filtrovány i další škodlivé látky jako pyly a spóry. Např. viry mají velikost od 0,05 do 0,12 μm.
U virů a choroboplodných zárodků je smysluplné použití elektrostatických filtračních systémů s přídavným filtrem HEPA (High Efficiency Particulate Air). Mají účinnost přes 99,95 %, mohou odlučovat částice větší než 0,01 µm a používají se pro odstraňování škodlivých látek ze vzduchu. Jejich použití se doporučuje zejména ve vysoce frekventovaných oblastech, jako výrobních provozech, konzultačních místnostech, velkoprostorových kancelářích, jídelnách a čekárnách. Elektrostatické filtrační systémy mají navíc dezinfekční a protizápachové vlastnosti, které ničí viry a baktérie a výrazně zlepšují prostorové klima.